ANOVA ou GEE?

Plusieurs méthodes existent pour analyser des données avec des mesures répétées.

Dans quelle situation est-ce préférable d'utiliser les équations d'estimations généralisées (GEE) plutôt que l'ANOVA à mesures répétées à deux facteurs (two-way repeated measures ANOVA)?

Deux des hypothèses de l'ANOVA à mesures répétées à deux facteurs sont 1) les données sont approximativement normalement distribuées et 2) la sphéricité des données. En pratique, il est très fréquent qu'au moins une de ces hypothèses n'est pas remplie.

De plus, les données manquantes ne sont pas traitées de la même façon avec l'ANOVA et le GEE. L'ANOVA supprime au complet les sujets avec au moins une donnée manquante, alors que le GEE supprime seulement les données manquantes et utilise toutes les données disponibles pour faire les analyses.